Maria Pia Paoli nata a Livorno si è laureata in Storia moderna nel 1976 col prof. Rosario Villari e col prof. Vieri Becagli.
Dal 1981 è in ruolo presso la Scuola Normale Superiore di Pisa come ricercatrice. Partecipando attivamente ai seminari di storia e storiografia dell'età moderna coi professori Furio Diaz e Mario Rosa ha sviluppato e approfondito in questi anni i propri interessi nel campo della storia culturale e religiosa dei secoli XVI-XVIII con particolare attenzione alla storia della Toscana medicea e lorenese.
Attualmente è Ricercatore universitario di Storia moderna presso la Scuola Normale Superiore di Pisa.