Margherita Mussi ha insegnato dal 1974 al 2009 alla Sapienza – Università di Roma. La sua ricerca si concentra sul Paleolitico italiano ed europeo e sulla fine del Pleistocene, sulla cultura e l'arte funeraria del Paleolitico e dell’evoluzione umana in Africa orientale. Ha scritto opere fondamentali sulla preistoria d'Italia. Mussi ha insegnato alla Sapienza presso il Dipartimento di Scienze dell'Antichità ed è stata professore associato per l'archeologia. È anche direttrice della Missione archeologica italiana di Melka Kunture e Balchit (Etiopia). Mussi si è laureata nel 1972 (Ecologia preistorica) alla Sapienza e si è diplomata nel 1975-76 alla Scuola Nazionale d'Archeologia di Roma. Nel 1973 ha partecipato a scavi in Somalia , poi nel Sud Sudan Juba. Si è occupata anche di siti archeologici del Medio Oriente mediorientale e dell'Afghanistan. In Italia, ha scavato in luoghi dell'Italia tirrenica, in Abruzzo, nel Fucino, e infine ha esteso il suo orizzonte di ricerca al Paleolitico di tutta Italia. Dal 1977 conduce scavi archeologici in Italia e in Africa orientale, dal 1992 nella Grotta di Pozzo e Altopiano delle Cinque Miglia (Paleolitico superiore e del Mesolitico), nel sud Sardegna dal 1999 e dal 2009 nella Melka Kunture etiope, più precisamente in Garba III. Dal 2009 ha lavorato come esperto di siti archeologici preistorici sul World Heritage Centre di UNESCO, più precisamente nel programma di evoluzione umana, adattamenti, dispersioni dello Sviluppo Sociale.