Enrico Giannetto si è laureato in Fisica teorica delle particelle elementari nel 1982 presso l'Università degli Studi di Padova, si è specializzato in Cosmologia dell'early universe alla SISSA di Trieste e in Storia della scienza alla Domus Galilaeana di Pisa, si è poi addottorato in Struttura della materia presso l'Università degli Studi di Messina.
Dal 1991 al 2001 è stato ricercatore di Fisica presso il Dipartimento di Fisica “Alessandro Volta” della Facoltà di Scienze dell'Università degli Studi di Pavia, dove ha insegnato fra l'altro Storia della fisica e Fisica generale.
Dal 2001 è diventato professore ordinario di Storia della fisica (FIS/08) ed è poi passato alla Facoltà di Lettere e Filosofia dell'Università degli Studi di Bergamo, dove insegna attualmente Storia della scienza, Storia del pensiero scientifico, Ermeneutica filosofica (M-STO/05).
Presso la stessa università dirige la Scuola di Dottorato in Antropologia ed Epistemologia della Complessità; dal luglio 2008 al febbraio 2012 ha ricoperto la carica di direttore del Centro di Ricerca sulla Complessità (CE.R.CO.), ora rinominato ISHTAR (Centro di Studi Storici Transdisciplinari sulle scienze e la filosofia); è stato coordinatore del corso di laurea in Filosofia dall'ottobre 2012 al settembre 2015. È stato, inoltre, presidente della Società Italiana degli Storici della Fisica e dell'Astronomia (SISFA) dal giugno 2006 al giugno 2012.
All'attività di fisico, Enrico Giannetto ha affiancato presto quella di storico della scienza e quella filosofica. È stato anche redattore della rivista di critica antispecista «Liberazioni». Ha pubblicato numerosi testi di filosofia teoretica come Un fisico delle origini. Heidegger, la scienza e la Natura, Donzelli 2010, e l'ultimo Note per una metamorfosi, Ortica, 2011. Ha pubblicato le sue ricerche sulle più prestigiose riviste di settore.

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